一种基于SLAF简化基因组测序数据的二次数据识别方法

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专利状态

一种基于SLAF简化基因组测序数据的二次数据识别方法

有效

专利申请进度

申请

2015-10-22

申请公布

2016-02-10

授权

2018-06-19

预估到期

2035-10-22

专利基础信息

申请号	CN201510695476.6	申请日	2015-10-22
申请公布号	CN105320848A	申请公布日	2016-02-10
授权公布号	CN105320848B	授权公告日	2018-06-19
分类号	G06F19/18
分类	计算；推算；计数;
申请人名称	北京百迈客生物科技有限公司
申请人地址	北京市顺义区南法信府前街12号顺捷大厦5层

专利法律状态

2018-06-19

授权

状态信息

授权
2016-03-09

实质审查的生效

状态信息

实质审查的生效IPC(主分类):G06F 19/18申请日:20151022
2016-02-10

公布

状态信息

公开

摘要

本发明提供了一种基于SLAF简化基因组测序数据的二次数据识别方法，优化index组合，使上机测序的两两index序列之间有3个碱基以上的差异；使用全局比对算法结合项目样品的index先验信息对一次识别后的未识别数据进行重新识别，通过构建畸变index数据库对数据进行二次识别，畸变index数据库包含所有以前SLAF测序项目产生的发生测序错误而未识别出index序列和其对应的原始index编号，根据以往积累的数据构建的数据库可用于识别当次的测序数据，不用每次都逐条对未识别index进行全局比对，大大节约时间，在确保识别可靠的基础上，通过增加识别的错配数提高数据的识别效率，减少可用数据损失。

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