一种基于三代测序检测多样本量比较转录组分析方法

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专利状态

一种基于三代测序检测多样本量比较转录组分析方法

有效

专利申请进度

申请

2019-12-31

申请公布

2020-05-15

授权

2023-06-06

预估到期

2039-12-31

专利基础信息

申请号	CN201911415269.5	申请日	2019-12-31
申请公布号	CN111161797A	申请公布日	2020-05-15
授权公布号	CN111161797B	授权公告日	2023-06-06
分类号	G16B20/00
分类	物理
申请人名称	北京百迈客生物科技有限公司
申请人地址	北京市顺义区南法信镇顺平路南法信段9号院1幢5层508室

专利法律状态

2023-06-06

授权

状态信息

授权
2020-06-09

实质审查的生效

状态信息

实质审查的生效；IPC(主分类):G16B20/00；申请日:20191231
2020-05-15

公布

状态信息

公布

摘要

本发明实施例提供一种基于三代测序检测多样本量比较转录组分析方法，方法包括：三代测序下机数据质控，获取三代全长转录本，进行CDS和PEP预测，基于预测结果进行基因家族聚类，获取直系同源基因、旁系同源基因和物种特有基因；对直系同源基因进行宏观进化分析、SSR检测和标记开发，以及进行功能基因定位，挖掘研究材料不同亚种或近源物种快速进化基因；对旁系同源基因进行WGD事件检测和个别家族的基因家族树分析；对物种特有基因进行数据库注释，明确研究材料的特有基因的特有功能。本发明实施例在处理多样本量比较转录组数据时，整体上，提供了一套完善的科学研究方法进行生物信息学的研究。

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