基于高通量测序数据的基因组从头组装方法

热门行业
装修建材
家居生活
餐饮食品
母婴教育
电脑办公
服装首饰
汽车工具
家电数码
机械化工
休闲美容

热门行业

教育培训
板材
地板
涂料
家纺
集成吊顶
美缝剂
木门
硅藻泥
管材
指纹锁
橱柜
衣柜
床垫
电热水器
集成灶
暖气片
净水器
酒店
卫浴

返回上一页

专利状态

基于高通量测序数据的基因组从头组装方法

有效

专利申请进度

申请

2014-08-25

申请公布

2014-12-24

授权

2017-07-28

预估到期

2034-08-25

专利基础信息

申请号	CN201410421844.3	申请日	2014-08-25
申请公布号	CN104239750A	申请公布日	2014-12-24
授权公布号	CN104239750B	授权公告日	2017-07-28
分类号	G06F19/18
分类	计算；推算；计数;
申请人名称	北京百迈客生物科技有限公司
申请人地址	北京市顺义区南法信府前街12号顺捷大厦5层

专利法律状态

2017-07-28

授权

状态信息

授权
2015-01-14

实质审查的生效

状态信息

实质审查的生效；IPC(主分类):G06F19/18；申请日:20140825
2014-12-24

公布

状态信息

公布

摘要

本发明提供了基于高通量测序数据的基因组从头组装方法，包括步骤：1)依据高通量测序数据构建de Bruijn图，基于纠错后的de Bruijn图进行测序数据纠错和super read组装；2)利用super read进行初级contigs组装；3)调取特定局部的初级contigs和reads，局部组装，将所有的局部组装结果合并；4)通过子图分割算法和模拟退火算法对contigs进行排序得到最终的scaffolds。本发明通过de Bruijn图纠错消除高通量测序带来的错误，提高了数据准确性；采用构建super read的方法提高测序读长，显著提升contigs长度；通过局部组装大大提升了重复序列的处理能力。

更多专利

全国服务热线：

在线客服

1211389656 咨询

商务合作

85926368 咨询

媒体合作

921888730 咨询

在线客服
客服微信号

品牌网官方客服微信

打开微信扫一扫

客服微信
商务合作微信

商务合作详谈

打开微信扫一扫

商务合作
回到顶部

在线客服

商务合作

媒体合作

客服微信号

商务合作微信