基于PacBio全长转录组测序数据的质控方法

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专利状态

基于PacBio全长转录组测序数据的质控方法

有效

专利申请进度

申请

2018-12-29

申请公布

2019-05-28

授权

2022-03-18

预估到期

2038-12-29

专利基础信息

申请号	CN201811641409.6	申请日	2018-12-29
申请公布号	CN109817277A	申请公布日	2019-05-28
授权公布号	CN109817277B	授权公告日	2022-03-18
分类号	G16B20/30
分类	物理
申请人名称	北京百迈客生物科技有限公司
申请人地址	北京市顺义区南法信镇顺平路南法信段9号院1幢5层508室

专利法律状态

2022-03-18

授权

状态信息

授权
2019-05-28

公布

状态信息

公布

摘要

本发明提供了基于PacBio全长转录组测序数据的质控方法，包括步骤：1）利用IsoSeq分析流程从原始PacBio全长转录组测序数据得到高质量和低质量的一致性全长序列；2）基于Illumina测序数据对低质量一致性全长序列进行校正，过滤仍达不到高质量标准的序列；3）合并高质量和校正后符合条件的低质量一致性全长序列，按照以下标准进行过滤：去除由序列嵌合产生的过长序列；去除自身比对结果中存在回文序列的一致性全长序列；去除能被其他一致性全长序列比对到多个位置的序列。通过多个标准过滤一致性全长序列中可能存在的嵌合序列，降低最终转录组中的假阳性结果比例，提高后续转录组相关分析结果的准确性。

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