亚群特异共表达网络鉴定方法

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专利状态

亚群特异共表达网络鉴定方法

有效

专利申请进度

申请

2018-07-09

申请公布

2020-01-17

授权

2022-04-05

预估到期

2038-07-09

专利基础信息

申请号	CN201810744911.3	申请日	2018-07-09
申请公布号	CN110706744A	申请公布日	2020-01-17
授权公布号	CN110706744B	授权公告日	2022-04-05
分类号	G16B20/20
分类	物理
申请人名称	深圳华大基因股份有限公司
申请人地址	广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层

专利法律状态

2022-04-05

授权

状态信息

授权
2020-01-17

公布

状态信息

公布

摘要

本发明公开了一种亚群特异共表达网络鉴定方法。本发明提供了一种待测样本亚群特异共表达网络鉴定方法，包括如下步骤：1）将待测样本亚群中每个样本的各个基因原始UMI数量数值均一化处理；2）将原始UMI均一化结果过滤，3）计算过滤后基因的两两加权中值相关bicor；4）将加权中值相关结果过滤，得到强共表达基因关系对；5）将所述待测细胞亚群过滤后的强共表达基因关系对，减掉在该亚群中所有细胞中均出现共有的强共表达的基因关系对，即得到该细胞亚群特异的共表达基因对；再用所述该细胞亚群特异的共表达基因对构建出待测样本亚群特异基因共表达网络。本发明针对亚群的方法更有针对性，更为灵敏。

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