本发明为一种白芍品种鉴定的引物、试剂盒、鉴定方法。该方法分别包括以下步骤:(1)提取不同品种的已知白芍DNA,分别加SEQ ID No.1至SEQ ID No.12所示的PCR引物进行PCR反应,分离所得已知白芍PCR反应产物,得到第一结果;(2)提取待测白芍DNA,分别加入SEQ ID No.1至SEQ ID No.12所示的PCR引物对进行PCR反应,分离所得待测白芍PCR反应产物,得到第二结果;(3)分析第一结果及所述第二结果,得出鉴定结果。该方法为白芍品种的区分提供一种简单有效可靠的分子鉴定手段,相比传统形态鉴别,不受采样时期和采样部位的限制,从基因层面对其进行鉴别区分,为解决白芍品种混乱和品种优劣区分提供新型鉴定手段。