本发明公开了一种A型赛尼卡谷病毒灭活疫苗及其制备方法和应用。所述的A型赛尼卡谷病毒灭活疫苗中含有灭活后的猪A型赛尼卡谷病毒全病毒颗粒抗原以及佐剂,其中所述的猪A型赛尼卡谷病毒全病毒颗粒抗原是由猪A型赛尼卡病毒全长感染性cDNA克隆通过病毒拯救获得的,所述的感染性cDNA克隆的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明将灭活的猪A型赛尼卡谷病毒全病毒颗粒抗原与兽医药学上可接受的佐剂相配伍,特别是兽医学上可接受的多聚赖氨酸羟甲基纤维素聚肌胞配伍,可提高灭活全病毒疫苗的免疫原性和效果,一头份就可产生完全保护,保护持续期1年。相比亚单位、病毒样颗粒疫苗,生产成本低,相比减毒活疫苗更加安全。