一种MHC补全数据库、其构建方法和应用

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专利状态

一种MHC补全数据库、其构建方法和应用

有效

专利申请进度

申请

2014-09-23

申请公布

2016-04-20

授权

2018-05-01

预估到期

2034-09-23

专利基础信息

申请号	CN201410490501.2	申请日	2014-09-23
申请公布号	CN105512514A	申请公布日	2016-04-20
授权公布号	CN105512514B	授权公告日	2018-05-01
分类号	G06F19/28;C12Q1/68
分类	计算；推算；计数;
申请人名称	深圳华大基因股份有限公司
申请人地址	广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层

专利法律状态

2019-01-01

专利申请权、专利权的转移

状态信息

专利权的转移；IPC(主分类):G06F 19/28；专利号:ZL2014104905012；登记生效日:20181213；变更事项:专利权人；变更前权利人:深圳华大基因股份有限公司；变更后权利人:深圳华大基因股份有限公司；变更事项:地址；变更前权利人:518000 广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层；变更后权利人:518083 广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层；变更事项:共同专利权人；变更前权利人:；变更后权利人:武汉华大医学检验所有限公司
2018-05-01

发明专利权授予

状态信息

授权
2016-05-18

实质审查的生效

状态信息

实质审查的生效；IPC(主分类):G06F 19/28；申请日:20140923
2016-04-20

发明专利申请公布

状态信息

公布

摘要

本申请公开了一种MHC补全数据库及其构建方法和应用。本申请的MHC补全数据库包括合成在一起的genotype数据集、HLA分型的型别数据集、氨基酸改变信息数据集和HLA单体型数据集；该数据库的构建过程中首次采用LD和HWE进行变异结果的过滤，提高了数据准确性；采用简单易操作的方法获得一个数量最少的SNP区分数据集，然后在phasing分析得到MHC单体型信息，相比于用整个SNP数据集进行phasing，本申请的构建方法更节约时间、减少CPU和内存使用，并且得到的单体型信息更准确。本申请的MHC补全数据库，包含了MHC区域的多种数据集，能够有效的补全位点，为MHC区域的深入研究奠定了基础。

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