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专利状态
用于衡量基因组不稳定性的试剂盒、探针及其应用
有效
专利申请进度
申请
2020-11-27
申请公布
2021-04-16
授权
2021-08-06
预估到期
2040-11-27
专利基础信息
申请号 CN202011360943.7 申请日 2020-11-27
申请公布号 CN112662767A 申请公布日 2021-04-16
授权公布号 CN112662767B 授权公告日 2021-08-06
分类号 C12Q1/6886
分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
申请人名称 深圳华大基因股份有限公司
申请人地址 广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层
专利法律状态
  • 2021-08-06
    授权
    状态信息
    授权
  • 2021-05-04
    实质审查的生效
    状态信息
    实质审查的生效
  • 2021-04-16
    公布
    状态信息
    公布
摘要
本发明提出用于衡量基因组不稳定性的试剂盒及其应用,试剂盒含有的探针集合是通过下列步骤确定的:将参考基因组序列划分为多个一级区域,一级区域含有至少一个已知的SNP位点;针对多个一级区域的每一个,进行SNP过滤;选择缺口区域;基于预期间隔,将缺口区域划分为至少一个二级区域;针对至少一个二级区域的每一个,分别进行二级高频SNP搜寻:由二级区域的中心点向两侧至少一次延伸处理;和在至少一次延伸预定长度之后,在所得到的区域中寻找频率最高的SNP,基于一级高频SNP和二级高频SNP汇总作为起始点SNP,确定三级区域;和基于三级区域,构建特异性识别三级区域的探针。利用该方法,能够有效地获得能够有效地用于分析基因组不稳定性的探针组合。