本发明公开了一种与玉米青枯病抗性基因紧密连锁的分子标记,为序列表SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列或序列表SEQ ID NO:2所示核苷酸序列。扩增该分子标记的引物对为序列表SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列和SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列。在用于玉米青枯病检测时,通过PCR扩增,若所得PCR扩增产物为234bp碱基片段,则待玉米为抗青枯病品种,若所得PCR扩增产物为274bp碱基片段,则待测玉米为青枯病感病品种。采用本发明方法可以在玉米播种前检测玉米是否具有青枯病抗性,进行有选择性地播种,缩短了育种时间,本发明方法快速简便,可广泛应用于玉米的辅助育种。