馆藏精品
陶瓷厅集中展示了余姚悠久而底蕴深厚的陶瓷文化，从河姆渡新石器时代的夹炭、夹砂陶，到三代时期的印纹陶和原始瓷，直到六朝至五代、北宋时期的越窑青瓷，都有精品展出，其中有新石器时代的鸟形陶盉 、战国时期的原始瓷香薰、西晋时期的青瓷蜥蜴把鸡头壶、越窑秘色瓷摩羯纹粉盒等，可谓琳琅满目，精品纷呈。此外，陶瓷厅还展出了不少元明清瓷精品，有元代龙泉窑青瓷蔗段洗，明代德化窑垂钓渔翁瓷塑、清代青花觚 、青花釉里红天球瓶、霁蓝瓶、五彩人物棒槌瓶、粉彩大盘等，展示了余姚文物部门几代人的收藏成果。 青铜玉杂厅陈列展出了石器、青铜器、骨器、玉器、金银器、砖瓦、印章、墨砚等大量杂件精品，有河姆渡新石器时代的石钺、骨匕、象牙圆雕鸟形匕，东汉时期的青铜弩机，东汉时期的四乳四神铜镜，唐代的双凤瑞铜镜，还有战国时期的玉壁，宋代的金卡虎，明代的金方牌、金耳挖，西晋的纪年砖、雁形生肖铜章，清代朱彝尊铭端砚等等。这些杂件虽然大多体量不大，却精致典雅，凝结着古代余姚人民生产、生活和艺术智慧的结晶，具有较高的历史和艺术价值。
根据中宣部等《关于全国博物馆、纪念馆免费开放的通知》要求，余姚市河姆渡遗址博物馆、余姚博物馆从5月18日起开始实施免费开放。为了让更多市民关注博物馆、走进博物馆。
建筑布局
余姚博物馆是在“第一山庙”原有建筑的基础上改建，增建而成的。设计建造者在依山傍水的环境中，将现代化建设与古建筑巧妙揉合在一起，使得布局错落有致，风格水乳交融，功能耦和配套。如今，青瓦粉墙、棂窗椅栏的博物馆已成为龙泉山西麓休瑕区的标志性建筑。
